Esta roca granítica que sirve de telón de fondo al municipio de Los Molinos, es uno de los elementos más identificables de esta zona montañosa de la Sierra de Guadarrama. El Alto de Peñota cuenta con una altitud de 1.945 metros y es el colofón de una cuerda con otros picos destacados, como el Cerro del Mostajo (1.717 metros) o la Peña del Cuervo (1.706 metros). Dicha cuerda nace en el puerto del León y divide el término de San Ildefonso (Segovia) con la Comunidad de Madrid. Además de unas vistas extraordinarias, esta cuerda se encuentra vertebrada por el camino GR10, que transcurre por algunos lugares más espectaculares de la Sierra de Guadarrama y cuyo enclave privilegiado también sirvió para la instalación de diferentes elementos militares (fortines, casas de montaña y búnkeres) durante la Guerra Civil Española (1936 a 1939). Dentro de su fisonomía hidrográfica cabría destacar: los arroyos de los Irrios y Peñota, que son afluentes del río Guadarrama, cuyo cauce atraviesa el municipio junto a su casco urbano.
